为更好促进民营经济健康发展，济宁高新区对产业结构进行调整和优化，以发展高科技、聚集新产业、培育新动能为核心， 以六大产业为主导，引导民营中小企业集聚集约发展，并把“一区十园”打造成培育发展战略性新兴产业和高新技术产业的核心载体，为高质量发展奠定坚实基础。

目前，济宁高新区确定了发展“3+3”产业集群，同步编制了产业链招商目录，百家企业培育、六大产业升级行动业已启动。积极开展“双解双促”活动，加快推进企业内生项目建设，促进本土企业延链扩能。2018年，如意全产业链等8个项目被列入山东省新旧动能转换库，伊顿汽车发动机核心零部件智能制造等79个项目被列入济宁市新旧动能转换项目库。

在民营企业发展方面，济宁高新区既要“参天大树”，也要“绿草茵茵”，打造强企方阵。培育龙头企业规模，引导中小企业向“专精特新”方向发展，打造出一批小而尖、小而优、小而强的“行业冠军”。为最大限度释放民营企业的创新潜力和发展活力，济宁高新区加快实施创新驱动发展战略，加强企业技术创新平台建设。坚持以隐形冠军培育作为激励手段，引导中小企业面向市场走“专精特新”之路，并获2018年国家中小企业创新创业升级载体5000万元资金扶持，遴选200多家民营企业分行业进行培育扶持。到位的政策也促进了一大批民营企业加快发展。